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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00357



RNA: SPR_00357
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((((......)))..((((.......))))))))).(((((.......))))))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))......
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.(((......))).(((((.......))))))))).(((((.......))))).))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...........................................................)))))))....
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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((...((.......))(((((.......))))))))).(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.(((.......)))((((.......))))))))).(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..[[[[[..)))).(((((..]]]]]))))).....(((((.......))))))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.[[[[....))))..]]]].................(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
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Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...)).
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PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.(((......))).(((((.......))))))))).(((((.......))))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
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UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.(((......))).(((((.......))))))))).(((((.......))))).))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((..[[[[[..)))).(((((..]]]]]))))).....(((((.......))))).))))))....