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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00359



RNA: SPR_00359
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..........((((...((.(((((((.......))))))).)).(((((....))))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))((((((.......))))))....((((((....)))))).)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....(((.........)))(((((((.......)))))))...((((((....))))))..))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.........)))(((((((.......)))))))...(((((((()))))))).)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.[[[[....))))((((((]]]]...))))))....((((((....)))))).)))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((.......[[[[[[[))))...]]]]]]]...(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((.(((((((.......))))))).))(((((......))))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((.(((((((.......))))))).)).((((......))))..)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...)))))((((((((((((((((((((...)..)))))))...(((((((..)))))))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((.(((((((.......))))))).))(((((......))))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.........)))(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.........)))(((((((.......)))))))...(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......)))))))...((((((....)))))).)))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.........)))))........((((((...........))))))........)))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......)))))))...((((.......))))..)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((.(((((((.......))))))).))(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(...)..)))((.(((((((((..)).))))))).))(((((((..))))))).)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((.(((((((.......))))))).)).((((......))))..)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((.(((((((.......))))))).)).((((......))))..)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....)))).........((((.(((((...[[[[))))).....(((((]]]]...)))))...))))....