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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00360



RNA: SPR_00360
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((((......))))))).)).(((((((......))))))).........)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................(((((.......)))))...((((((.......))))))..........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..................((((((.......))))))..((((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.................((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((....................((((((.......))))))(.((((((.......)))))).)))......
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((.(((((((......))))))).)).(((((((......)))))))..........))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...................(((((.......)))))...((((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((....)))))))((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..................((((((.......))))))..((((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((......)))))))....(((((((......)))))))..(((......)))......
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ........................((((((.......))))))..((((((.......))))))..........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......(((...)))(((.((((..(((((((..))).))))..(((((((.((..)))))))))..)))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))....(((((((......))))))).........)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((....((((....))))..((((((.......))))))...(((((.......))))).))))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((...........)))).(((((((((....[[[))).....((((((]]]....)))))).))))))...