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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00365
RNA: SPR_00365
Rfam family:
-
| AUGGUAAUUAGUUUAAAUAAAAUUAAUGAUUUCGACUCAUUAGAUUAUGAUAAUAAUCAUAAUUACCAACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | .(((((((..((((.....))))((((((.......))))))...(((((......)))))))))))).... | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).)))))))))...) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((.((((.((((..........)))).)))).))).(((((((((....)))))))))....)))) |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((..............(((((.......)))))......(((......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((..............(.(((((.......))))))...(((((......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((((((((.......)))((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.(((....)))..((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((..............(((((.......))))).((((((....)))))).))))))))).... |
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| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..))))).((((((((...))))))))(((((((..))))))).))))))))))... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((..............(((((.......))))).((((((....)))))).))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((((((.....))))((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((((((((([[[..))))((((((]]]....))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......................((((((.......)))))).((((((((....))))))))......... |
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| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((.............((((((.......))))))((((((....)))))).))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((((.((((.....)))).(((((.......))))).((((((....))))))..)))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((...((((((.....)))))).(((.......)))...(((((((((....)))))))))....))). |