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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00370



RNA: SPR_00370
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.(((((.((...)).(((((.......)))))..)))))((((...))))))).)))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))...........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))(((.(((((.(((((....))))).))))).)))......)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.......))))(((.(((((.(((((....))))).))))).)))...)).)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.[[[[))).........]]]]......(((((....))))).....(((..[[[)))...]]].........
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((.((......)).)))).(((((.......)))))......(((((((.((.......))))).))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(((((......(....)..(((.((((..(((((....)))))..)))).)))..))).))..)))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).......................(((((.......))))))))))))....
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Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))........(((((.......)))))))))))).
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((.((......)).))))......(.(((....))).).....((((((............))).))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))...).
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))...).
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
PPfold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((...(....)))))).(((((((....))))).))(((((.......))))))))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..(......)...)))...((((((.......)))))).)...(((((((.............)))))))
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........................................(((((.......)))))))))))...).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(((((......(....)..(((.((((..(((((....)))))..)))).)))..))).))..)))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(((((......(....)..(((..(((..(((((....)))))..)))..)))..))).))..)))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((..((......))..))))...(((((..((((....)))).((((.......))))....)))))...
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((..((......))..))))...(((((.(((((....))))).(((.....))).......)))))...