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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00374



RNA: SPR_00374
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.((..(((...(((....)))))))).))))((((((.........))))))..)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))..((((.......))))((((((.........))))))..)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.((((.......))))))(.......))).......(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((((.......))))))(.......))))......(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.[[[...)))))]]]..(((((.......))))))))))))....
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((..........[[[...))))......]]].((((((.........))))))..)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.((((.......))))))))((((......))))...((((.......)))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.....(((...(((....))))))...))).((((((.((....))))))))..)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.((((.......)))))))).............((.[[[[[.....))]]]]])))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.((((.......)))))))).(((......))).....(((.......)))..)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))..((((.......))))((((((.[[[[....))))))..)))))))]]]]
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))...).
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.((((.......))))))))((((......))))..(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.....(((...(((....))))))...))).((((((.((....))))))))..)))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((.((((((.......))))))(((........))).................))).)))))).....
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.....(((...(((....))))))...))).((((((.((....))))))))..)))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.....(((...(((....))))))...))).((((((.((....))))))))..)))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.....(((...(((....))))))...))))((((((.((....))))))))..)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((((.((..))))))))))((((......))))...(((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.....(((...(((....))))))...))).((((((.........))))))..)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.....(((...(((....))))))...))).((((((.((....))))))))..)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))...(((.......))).((((((.((....))))))))..)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))...(((.......))).((((((.((....))))))))..)))))))....