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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00385
RNA: SPR_00385
Rfam family:
tRNA
| GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCUGAAGGGAUCGGUCUUGAAAACCGAGAGUCGGGGAAACCCGAGCGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((.............))).(((((.......)))))...................(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.(((...)))...))).(((((.......)))))((((((((....)))))....((((....)))))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.............))).(((((.......)))))...(((((....)))))..((((((....)))))).))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....((((.((((.........)))).))))...........(((((....)))))..((((((....)))))).))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....((((.((((((....)).)))).))))...........(((((....)))))..(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.............))).(((((.......)))))...(((((....)))))..(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....((((.((((((....)).)))).))))..........((((((....))))).)(((((((()))))))).))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((.............))).(((((.......)))))...(((((....)))))..((((((....)))))).))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((......[[[...))).......]]].(((((((((.....))))).(((((....)))))[[[[[[[.)))).........]]]]]]].. |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....((((.((((((....)).)))).))))...........(((((....)))))..(((((......))))).))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....((((.((((((....)).)))).))))...........(((((....)))))..(((((......))))).))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....((((.((((((....)).)))).))))...........(((((....)))))..(((((.......)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......(.((.(((....)).).)).)(((.....)))...(((((....)))))..(((((......))))).))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((....(((((((..[[[[[[((((.......))))..)))))))....((((..)))))))....]]]]]].))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((...........)))).(((((.(...).)))))...................(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((...........)))).(((((.(...).)))))...................(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((......))((((.....))))(((((.....)))))((((((....))))).)(((((.......)))))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((......).)))).((((.....)))).((((((....))))).)((((((....)))))).))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ................((((((.......(((((.......))))).))))))..........(((((((..............))))))).. |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....((((.((((.........)))).))))...........(((((....)))))..((((.......))))..))))))).... |
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| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..........((((((....)).)))).((((.....))))..(((((....)))))..(((((.......))))).)))))).... |
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