 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00388
RNA: SPR_00388
Rfam family:
tRNA
| GGAGAGCUGUCCGAGUGGUCGAAGGAGCACGAUUGGAAAUCGUGUAGGCGGUCAACUCCGUCUCAAGGGUUCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...................(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((.(((((((.((((((((((...)))))))...((((......))))))).....)))).))).)))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((.(((((((...((((((((...))))))))((((((......))))))......)))))..)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................((((((((...))))))))((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((...........)).((((((((...))))))))((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((...........)))((((((.......)))))).(((((......))))).((((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(.(.(((((((((.....((((((((...))))))))...))))).)))).).)..(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......[[[[[)))((((((((...))))))))((((((......)))))).(((((]]]]]..)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......[[[[[)))((((((((...))))))))((((((......))))))......]]]]].......))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((.((....)).)))..)))))........((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((.((....)).)))..))))).....((.((((((......)))))))).(((.......)))..))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((((.....)))))))((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((..))))))((((.....((((((((((((((.(((((((....)))))))))))))))))))))))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(......)......((((((((...))))))))((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....(((....))).....((((((((...))))))))((((((......))))))((((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))....................(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))....................(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((....))((....))(((((((.....)))))))((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((.((....)).)))..)))))........((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................((((((((...))))))))((((((......)))))).((((((....).)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((......)))(((((((((......(((((((...)))))))....)))))).........((((((.......)))))))))....... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................((((((((...))))))))((((((......))))))...((((....))))...))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((.((....)).)))..)))))........((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((.((....)).)))..))))).....((.((((((......)))))))).(((.......)))..))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......(((.((....)).)))((((.(((..(.((.((((((......)))))))).)..))).))))....))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........).)))((((((.......))))))((((((((..))))))))(((((((...)..)))))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((.((....)).)))..)))))......(.((((((......))))))).((((.......)))).))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((.((....)).)))..)))))........((((((......)))))).(((((.......)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((((.....))))))).(((((......)))))...((((.......)))).))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...........(((((...(((((((.....))))))).(((((......)))))....[[[)))))..]]]..))))))).... |