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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00390
RNA: SPR_00390
Rfam family:
tRNA
| GGUGAGGUGGCCGAGAGGCUGAAGGCGCUCCCCUGCUAAGGGAGUAUGCGGUCAAAAGCUGCAUCCGGGGUUCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......))))))....................(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((..((((((....)))...((((((((((.......))))).(((((((.....)))))))..(((((....))))))))))))))))). |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))......((((((.......))))))(((((((.....)))))))..(((((....))))).)))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))......((((((.......))))))(((((((.....)))))))..(((((....).)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))).....((((((.(....)))))))(((((((.....))))))).(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......((((((.......))))))(((((((.....))))))).(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))...((.((((((.......))))))(((((((.....)))))))))((((((())).)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.............((([[[[[[..)))..]]]]]](((((((.....)))))))...((((....)))))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))......((((((.......))))))(((((((.....)))))))..((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......((((((.(....))))))).((((((.....))))))..(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......((((((.......)))))).((((((.....))))))..(((((.......)))))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))......((((((.......))))))(((((((.....)))))))..((((.......)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......(((((.((....))))))).((((((.....))))))..(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))).....((((((.......))))))(((((((.....))))))).(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....................(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....................(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....)))....((.((((((.......))))))(((((((.....)))))))))(((((....)))))))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......(((((.((....)))))))(((((((.....))))))).((((((....).)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......((((((.(((..........)))((((....))))......))))))...........(((((.......)))))........... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((.................((((((.......))))))(((((((.....)))))))..(((((....)))))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((....))))......((((((.......)))))).((((((.....))))))..(((((.......)))))))))))).... |
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| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((..)))))......((((((.(....)))))))((((((((...))))))))..(((((...)..)))))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((....))))......((((((.......))))))(((((((.....)))))))..((((......)))).)))))))).... |
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| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((....((((....))))..((((((((((.......)))))).((((((.....))))))...(((((....))))).))))...)))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((....((((....))))..((((((((((.......)))))).((((((.....))))))...(((((....))))).))))...)))). |