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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00391



RNA: SPR_00391
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))...............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(((...((((.((((.....((((((.......))))))...)))).))...))(((((.........))))).))))))).
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((.....((((((.......))))))...))))........((((((....)))))).)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....((((.((((.....((((((.......))))))...)))).))...))((((((....).))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((.......))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.......))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....((((.((((.....((((((.......))))))...)))).))...))(((((((())).))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...[[[[....)))((((((.......))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))]]]]
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.((((((.....))).))).))))........(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.((((((.....))).))).))))........(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.((...........[[[)).))))....]]].(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.((((((.....))).))).))))........(((((....))))).(((((......))))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...[[[[....)))((((((.......))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))]]]]
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))................(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))................(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((...........)))((((((.(....)))))))(((((....))))).(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.((((((.....))).))).))))........(((((....))))).((((((....)))))).)))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............((((...(((..(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......))))))))....))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((.....((((((.......))))))...))))........(((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........).)))((((((.(....)))))))((((((..)))))).((((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.((((((.....))).))).))))........(((((....))))).(((((......))))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((..((((((.....))).)))..)))........(((((....))))).(((((......))))).)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.((....))))))).((((....))))..((((((....)))))).)))))))....
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