 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00393
RNA: SPR_00393
Rfam family:
tRNA
| GGAAGUGUGGCCGAGCGGUUGAAGGCACCGGUCUUGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGUUCCAGAGUUCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.((((..((((.......))))...........))))(((((....)))))..((((.......)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((...((......(((((.......)))))..((((....))))..))..))))).....)))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((...................(((((.......))))).(((((....)))))..((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((...................(((((.......))))).(((((....)))))..((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(((...........))).(((((.......))))).(((((....)))))..((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((...........(((((.......))))).(((((....))))).....))))).....)))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((((((.(((((....)))))...))))...(((((....))))).....))))).....)))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(.(((((..((.(((((....))))).))....((.(((((....)))))))...))))).....)..))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((........(((.(((((.[[[)))))...)))]]].(((((....)))))...(((.......)))))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.(.((((((((((....)))))))))))))))((((((..)))))).((((((...)..)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((..))))))......(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))................(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))................(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))).(((((.......))))))(((((....))))).(((((.......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((..((.(((((....))))).))....((.(((((....)))))))...))))).....)))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((......((((.......(((((.......))))).....((((............)))))))).)))))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.....(((((.(((((....)))))...)))))..(((((....)))))...............)))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(.(((((..((.(((((....))))).))....((.(((((....)))))))...))))).....)..))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((..((.(((((....))))).))....((.(((((....)))))))...))))).....)))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(.(((((((((.(((((....)))))...))))((.(((((....)))))))...))))).....)..))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((..))))).))....((((.((..)..))))).((((((..)))))).((((((...)..))))).)))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.(.(((((..........................((.(((((....)))))))...))))).....).)))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(.(((((..(((......(((((.......)))))..((((....))))..))).))))).....)..))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........((((....))))...(((.(((((.......))))).(((((....))))).(((((.......))))).)))....... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.....((((....)))).(((...[[[[[)))....]]]]]..((((....))))))).(((.......)))............. |