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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00395
RNA: SPR_00395
Rfam family:
tRNA
| GGAUGGUUGACUGAGUGGUUUAAAGUGUGAUAUUUGAGCUAUCAUUAGUCUUUAUUGGCUACGUAGGUUCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((...........)))((((((.......)))))).................(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((((((((((((........))))))))))..))))))............(((((.......)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..((((((((((((((((........))))))))))..))))))............(((((.......))))).)))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......(((((((((((.((((((.......))))))....)))))..))))))(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......((((((((((........))))))))))...(((((......))))).(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................((((((.......)))))).((((......))))..(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......(((((((((((.((((((.......))))))....)))))..))))))(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......((((((((((........))))))))))...(((((......))))).(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((((((((((((........))))))))))..))))))............(((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....(((.(((((((((........)))))))))))).(((((......))))).(((((.......))))).)))))).... |
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| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.[[[[[(({{{{.{{{{{{...))..}}}}}}))))}}}}....]]]]](((((.......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((((((((((((........))))))))))..))))))..((.....)).(((((.......)))))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....(((.(((((((((.((...)))))))))))))).(((((......))))).((((((....).)))))))))))).... |
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