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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00398



RNA: SPR_00398
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (.((...(........)(((((.......)))))......((((.........))))...)).)...
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((((((((((........)))))))....)))).......)).))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((.......).)))))))((((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............((((((((.......).)))))))((((((.......))))))..........
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((........))))))))((((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((.......).)))))))((((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............((((((((........))))))))((((((.......))))))..........
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((((((........)))))))).(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((((((........)))))))).(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((..(((((((((((..))))))))))).(((((..)))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((((((........)))))))).(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((........))))))))((((((.......))))))))))))....
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((..((((((((.[[.[[..))))))))]]{{{{.))))..}}}}))))))))..]]
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.....)((((((((........)))))))).(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((((((........)))))))).(((((.......))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............(((((((..........)))))))((((((.......))))))..........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..((((((((((((........))))))))....)))).........))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((........))))))))((((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((..))).(((((.(....))))))....((((((((..)).))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((((((........))))))))..((((.......)))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))..((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))...(((.......))).))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((((((((........))))))))...(((.......))).))))))))....