 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00399
RNA: SPR_00399
Rfam family:
-
| AAAGGUAAUUAGGAAUAAAAUAAAGCUGCUAACUUUAUUUUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(..(..)..).(((((.......)))))......(.(...........).)))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((((...(((((.......)))))(((((((...))))))).)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....((((((......((.((((............)))).))......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((((((.......)))))))))(((...)))..........))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((((((.......)))))))))...................))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((((((.......)))))))))(((((.........)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((((((((((((.......)))))))))(((...)))......))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((((((.......)))))))))(((((.........)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....[[[[[[[[[)))....]]]]]]]]](((((.........)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....((((((.(((((((.......)))))))(((((...)))))...)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......(((((((.......)))))))(((((...)))))..)))...))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((((((.......)))))))))(([[[..)).....]]]..))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((((..(((((((((((((((.((..)))))))(((((((...))))))).)))))))))))))))) |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((((.(((((((.......)))))))(((((...)))))...)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((((((.......)))))))))(((((.........)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((....[[[..(((((((((.......)))))))))(((((.........))))))))))..]]]. |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....(((((((((.......)))))))))(((...)))....)))...))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((((.(((((((.......)))))))(((((...)))))...)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((...)))(((((((((.......)))))))))(((((.........)))))))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....((((((.........((((............)))).........)))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....(((((((((.......)))))))))(((...)))....)))...))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....(((((((((.......)))))))))(((...)))....)))...))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.........(((((((((.......)))))))))(((((.........)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(....)..(((((((((.(....))))))))))((((...........))))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....((((..(((((((.......)))))))(((((...)))))....))))))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....((((((..((((((.......))))))((((((...))))))..)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((..((((((((.......)))))))).(((((.........)))))......)))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((..((((((((.......)))))))).(((((.........)))))......)))). |