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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00402
RNA: SPR_00402
Rfam family:
tRNA
| GAGAGAGACAUAGAGGUUAUGAUGUUGGCUUGAAACCAAUAGUAGGGGGUUCGAUUCCUUCCUUUCUUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((.(((.......))).((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....((((((((..((((((.......))))))))))............))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((((...))))).((((((.......))))))..(((((((...))))))).))))))).... |
| Carnac(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................................................................ |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((........................................................)))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......................((((((.......))))))...(((((.......))).)).......... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(...................((((((.......))))))..((((((.......))).)))..)...... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((.....)))).((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.....(((.......[[[[[[)))....]]]]]]...(((((.......)))))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((.....)))).((((((.......))))))...(((((......))))).))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............((((((.......))))))...(((((......))))).))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((.................(((((.......)))))......(((.......)))...)))))..... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((.((((((((((((.((..))))))))))))))(((((((((..)))))))))))))))))).. |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((.......)))..(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................................................................ |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((.....)))).((((((.......))))))...(((((......))))).))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((((...))))).((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
| PPfold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................................................................ |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((.....)))).((((((.......))))))(.((((((.....)))))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............((((((.......))))))...(((((......))))).))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((((...)))))(((((((.......)))))).).((((((...).))))).))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((.((((.....)))).((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))..... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............((((((.......))))))...(((((......))))).))))))).... |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............((((((.......))))))....................))))))).... |
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