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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00416



RNA: SPR_00416
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((..........)))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (..(((((((((....)))))))))(((((((((..........((((...))))..((((.......)))).))))).)))).)
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))))......((((....((....((((...))))))((((.......)))).))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((....)))))))))(((((((((.........(((((...))))).((((.......)))).))))).))))..
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....))))))))))(((((.......))))).((((...))))..(((((.......)))))...........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))....((((((.......))))))((((...))))..(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((..........)))((((((.......))))))((((...))))..(((((.......))))).))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....))))))))))(((((.......))))).((((...)))).((((((.......)))))..)..))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....))))))))))..(((((...........((((...))))..(((((.......))))))))))......
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((....)))))))))(((.[[[[......))).(((((...))))).(((((.......)))))]]]].......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....)))))))))).((((.(....))))).(((((...))))).(((((.......))))).(((...))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....)))))))))).(((((((..........((((...))))..((((.......)))).))))).))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....))))))))))((([[[[.......))).((((...))))..(((((.......)))))]]]].......
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((..)))))))))))(((((.((..)))))))((((((..(((((.((((((...)..))))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....)))))))))).((((.(....)))))..((((...))))..(((((.......))))).(((...))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((..)))))))))))(((((.......)))))(((((...))))).(((((.......))))).(((...))).
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))..............(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((....)))))).((((((((.......))))).(((....))))))(((((.......))))).))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((....)))))))))(((((((((..........((((...))))..((((.......)))).))))).))))..
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....))))))))))(((((.(....))))))(((((...))))).((((((....).))))).(((...))).
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....)))))))))).................(((........((((((((.......)))))..)))...)))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....)))))))))).................(((((...))))).(((((.......)))))...........
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((....)))))))))(((((((((..........((((...))))..((((.......)))).))))).))))..
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((....)))))))))((((((((..........(((((...))))).(((((.......))))))))).))))..
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((..)).))).(((((((...((......))..)).((..))......((((.((((((...)..)))))))).)).))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((....)))))))))).(.((((...........((((...))))..(((((.......)))))))))..)....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((..((....))..)))))(((((((((..........((((...))))..((((.......)))).))))).))))..
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((....)))).((((....))))..........((((.....)))).(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((....)))).((((.[[[)))).......]]].(((.....)))..(((((.......))))).))))))....