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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00434



RNA: SPR_00434
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...........((((...((((((((.....))))))))...)))).....))).)))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.........(((..((((...(((((((.......)))))))...))))....)))..)))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.(....).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.(....).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.[[[[[..)))).(((((]]]]]..))))).....(((((.......))))))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((..[[[[[[[[)))..]]].]]]]].....((((((((......)))..))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((.....))).))))).....((((((((......)))..))))).))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((([[.....))))).]]..(((((.......))))))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..)))))))))((((.((..))))))(((((((((..)))))..)))).)))))))....
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((........)))..(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............((.(.(((((.......))))).).))(((((.......))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).....))))).
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PPfold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))...(((((((.......)))))))((((.......)))).)))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((.....))).))))).....((((((((......)))..))))).))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((([[[....)))))]]]...((((.......)))).)))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))....((((((.......))))))(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((((((........)))).(((((.......)))))......(((((...)..))))))))))))....
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))........................................)))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((........((((((((.....))).))))).....((((((((......)))..))))).))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))....((((((.......)))))).((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.[[[[[..))))..((((]]]]]..))))..((((.{{{{...))))}}}}..))))))....