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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00437



RNA: SPR_00437
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(..(..((((........)))).((((((.....)))))).....((((.......))))...)...)....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((([[[[[[..)))).((((((.....))))))....(((((.]]]]]]))))))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((.[[[[[[[)))).(((((((...)))))))....(((((.......)))))]]]]]]]....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((([[[[[[..)))).(((((({{{{.))))))....(((((.]]]]]]))))))))))))}}}}
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MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..((((((((((((...)))))))))))))))))).)))))...))))))))....
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
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PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
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PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
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TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.[[[[[..)))).((((((.....)))))).....((((.]]]]].)))).)))))))....