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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00439
RNA: SPR_00439
Rfam family:
tRNA
| GCCUGGUUAGCAUAAAAGUAAUGCAAUUGUUUUGUAAUCAAUAGAAGCAAGUGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA | |||
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| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))))))))))).... |
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| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((....(((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))))))))))).... |
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| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.......))))..(((.........))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((....(((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..............(((((.....)))))..........(((((((...)))))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((....((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))))))))))).... |
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| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((...))))))))(((((((((..)))))))))(((((((...)))))))))))))).... |
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| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.......))))......................(((((((...)))))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))).... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.......))))...))((((((.....))))))((((((.....))))))))))))).... |
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| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.......)))).....((((((.....))))))((((((.....))))))))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((........(((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))..))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((..((..(((....((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))))))..))).... |
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| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((..((..(((....((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))))))..))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((((.((((((((((...((((((((.............).)))))))...)))))).)))).)))))) |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((..((..(((....((((.((((.(((((((..........))))))).)))).)))))))))..))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((..((..(((....((((..(((.(((((((..........))))))).)))..)))))))))..))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((.......)))).((((.........))))....((((((.....)))))).)))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((.......)))).((((.........))))....((((((.....)))))).)))))).... |