 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00458
RNA: SPR_00458
Rfam family:
tRNA
| GAGAGAUUAGCUCAGUUGGUAGAGCAACCGUUUUACACACGGAAGGUUGGGUGUUCGAAUCACCCAUUUCUCACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))).......... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((....((((........)))).(((((.......))))....)((((((.......)))))).))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((............(((((((....)))))))...........((((((.......)))))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((...[[[[.))))..((((.......)))).(((.((((((.......))))))..))).]]]] |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))).)))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.....((((....[[[.))))..((((.......)))).....((((((.......))))))..))))]]]. |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))).)))(((((((...)..)))))))))))))).. |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......))))......(((((.......))))).)))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........))))((((.((((......))))))))(((((.......)))))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.(.((((....[[[[))))).((((..]]].])))).....(((((((....).)))))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))).......... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(......).(((........)))(((((((...........)))))))((((...(((........))).)))). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.........................................((((((.......)))))))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......)))))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((...((((........))))..((((.......)))).....((((((.......))))))..)))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((...((((.....[[[))))..((((..]]]..)))).....((((((.......))))))..)))).... |