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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00459



RNA: SPR_00459
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(.(((.......))).))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.....)))...((((((((.......)))).........)))).......)))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....((..(((((((..((((.......)))).....)))).)))..))...)))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((................(((((..............))))).............)))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......)))))........(.......)....)))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((((........))))).............(((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((.((.....(((((.(((......))).)))))....)).)))...)))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((((...[[[[[)))))..]]]]]...................)))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((((........))))).(((.(((....)))...))).....)))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((.(((....(((((.(((......))).)))))...))).)))...)))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((.(((....(((((.(((......))).)))))...))).)))...)))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....................................................)))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((((((((((((.(((((((((.(...))))))))))))))))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((.(((....(((((.(((......))).)))))...))).)))...)))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.................(((((.......)))))....(((((..)))))...)))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........)))).(((((.......)))))(....)(((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((((........))))).(((.(((....)))...))).....)))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.[[[.[[[))))(((((.(((......))).)))))...]]].]]]...)))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................(((((.......)))))................................
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((........)))).(((((.......)))))...................)))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((((........))))).(((.(((....)))...))).....)))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((((........))))).(((.(((....)))...))).....)))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((((........))))).(((.(((....)))...))).....)))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(...(((((........)))))....).)))).(((((..)))))...)))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.........(((....(((((..............)))))...))).......)))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.....(((.(((....(((((.(((......))).)))))...))).)))...)))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((........)))).(((((.......))))).....(((....))).((((....))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((.....[[[))))...(((..]]]..))).......(((....))).((((....))))....