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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00462



RNA: SPR_00462
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.....)))).((.((.......)).))....((((.......)))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........)))))((((.....))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((.......)))....(((((.........))))).............))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....)))).......................(((.......)))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....)))).((.((.......)).)).....(((.......)))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....))))..........................((((...)))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....)))).....(...............).((((.....))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........)))))((((.....))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........)))))((((.....))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........))))).(((.....))).))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.(.....).))))).............))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))........................((.......)).))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((((((((((((.(((((..)))))))))))))))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........))))).(((.....))).))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........))))).............))))))))....
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))((..(((((.......{{)))))[[[[}})).]]]]))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....)))).(((((.(...).)))))....((((.......)))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........)))))((((.....))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))................(((.......))).......))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........))))).............))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....))))......................(((((.....))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.(.....).))))).............))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.(.....).)))))((((.....))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((..........))))))).)))......((((.......)))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....)))).....((((.........))))..(((.....))).))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.....))))....(((((.........))))).............))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....)))).....((((.........)))).((((.....)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....)))).....((((.........)))).((((.....)))).)))))))....