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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00467



RNA: SPR_00467
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.((((...))))...........)))))........((((.......))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((...........)))).))))).......((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.....((((((((...(....)..)))).))))........((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.((((.............)).)))))))........((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......((((((((...........)))).)))).......(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).))))).......((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((..[[[[[)))))))(((((.......)))))......(((({{{{...)))).}}}}]]]]]..
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((..[[[.....)))..........]]]...........((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((..........))).(((((.......))))).((.(((......))).))..))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.......................................(([[[[....)).]]]]))))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((.(((((((..)))))))))))))))))))((((((((..)))))))).(((...)))))).
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((.......)).(((((.......))))).((.(((......))).))..))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((...)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))...))).
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))...))).
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((...[[[[[[))))))(((((.......)))))...(((((((.......))))).))]]]]]]..
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........(((((.....[[[[[.)))).)]]]]]....(((......))).....))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((((..........))))))..............))))).((((.......))))............
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((((((((...........)))).)))))......(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).))))).......((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((......)))))((((((.((..)))))))).....(((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....(((((((((..((....)).)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.......))))...(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.(((.....))).[[[[[...))))]]]]]......((((.......))))))))))))....