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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00478



RNA: SPR_00478
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............(((((((((.......)))).)))))(((((......))))).)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............(((((((((.......))))).)))).((((......))))..)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((.......))((((((((.......))))).)))....((.......))...)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(..((.......))((((((((.......))))).)))...(((.......)))).)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..[[[[.)))).(((((.......))))).....(((((......))))).)))))))]]]]
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........(((...[[[[[[[[[..)))..]]]]].]]]](((((......))))).)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((......))))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............(((((((((.......))))).))))(((((......))))).)))))))....
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MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))(((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((......))))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((........(((((.......))))).)))))))..............)))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((.....)))..(((((((((((((((.......))))).))))(((((............)))))))))))
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............(((((((((((((((.......))))).))))(((((............)))))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((......))))).)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............(((((((((.......))))).))))(((((......))))).)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.......)))).((((.(......)))))......(((........))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............(((((((((.......))))).))))(((((......))))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............(((((((((.......))))).)))).((((......))))..)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((......))))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((......))))).)))))))....