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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00481



RNA: SPR_00481
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((.((((((...............))))))...........)))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........(((....((((((((.......)))))....)))....)))........)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((............((((((((.......)))....)))))...........))).)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).......(((.......)))..)))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((......(.....((((((((.......)))....))))).....).....))).)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......(((((...[[[[[[.........))))).]]]]]](((.......)))..)))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........(((.(((...[[[[))))))...]]]]...(((.[[[..)))..]]]..)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....(((....((((((...............))))))....)))....))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....(((....((((((...............))))))....)))....))).)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((.......))))).......(((.......)))..)))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.(((((((((...)))))(((((((((..)))))))))))))))))))).)))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((............((.(((((.......))))).....))...........))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((((((...............))))))(((((..)))))...)))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((....))))((((((...............))))))((.......))))).)))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....(((....((((((...............))))))....)))....))).)))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....(((....((((((((.......)))))....)))....)))....))).)))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.............((((..((((.......))))..........)))).........)))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((((((...............))))))...............)))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....(((....((((((...............))))))....)))....))).)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....(((....((((((...............))))))....)))....))).)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............(((((((.(((((((.......)))).)))...)))..)))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..................................................))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....(((....((((((...............))))))....)))....))).)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).......(((.......)))..)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).......(((.......)))..)))))))....