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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00489



RNA: SPR_00489
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((.((((((((........(((((...)))))))))))))............)).)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((((((.....................)))))))((((.......)))).)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......((((........((((((.....)))))))))).((((.......)))).)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....((((.......)))).)))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((((........(((((((...))))))))))))((((.......)))).)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........[[[[......(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))]]]]
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((.......)))).)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((((((.......(((....)))....))))))).(((.......)))..)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(((((.....)))))......((((.......)))).)))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((..(.((((..)))))))))))))))))(((...)..))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((.......)))).)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((((.....))))))....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((((((.......(((....)))....))))))).(((.......)))..)))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((((((.......(((....)))....)))))))((((.......)))).)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((((...(((..((((..)))))))..))))))))))....(......))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................((((((...))))))......((((.......)))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((...)))))))....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....((((.......)))).)))))))....