 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00505
RNA: SPR_00505
Rfam family:
tRNA
| CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGUAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCCCCGCUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.((...)).))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))....) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((...((((((((.....))))))))......)))......(((((.......)))))))))))..... |
| CMfinder(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))........ |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| Carnac(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((....................(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((....................(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((...(((.........)))(.(((((.......))))).)...(((((.......)))))))))))..... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..(((([[[[[[[..)))).]]]]]]]....(((....))).(((((.......)))))))))))..... |
| DAFS(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..(((.((((....))))..[[[[[)))....]]]]].....(((((.......)))))))))))..... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).))))))..... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((......((............[[[[[)).....]]]]].....(((((.......)))))))))))..... |
| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...(((.........))).((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))...). |
| Mastr(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| Multilign(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| Murlet(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))...... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PPfold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((((....((((((((.....))))))))))..(((....))).(((((.......)))))))))))..... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).))))))..... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| RNASampler(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| RNAalifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((.(((..((((..(..(((..(((((.......))))).)))..).))))....)))...))))))..... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....((((......))))((((((...(((((.......))))).((..(((((.......)))))..)))))))). |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((.......)))))((((((..(...)))))))....(((((.((..))))))))))))).)... |
| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..........................................(((((.......)))))))))))..... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((....................(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| TurboFold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..... |