RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00512

RNA: SPR_00512
Rfam family: tRNA

			CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCAGAGGUUCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.((...)).))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))....)
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((.........)))).(((((.......))))).((..(((((.......)))))..)).......
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..(((((((...))))))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..(((([[[[[[[..)))).]]]]]]]...............(((((.......))))))))))).....
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.....................((((.......))))......(((((.......)))))))))))...).
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.[[[[....)))).(((((.......)))))]]]].(((((.......))))))))))).....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..(((([[.......)))).(((((]].....))))).....(((((.......))))))))))).....
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(.(((((.(((((((...)))))))((((((((...))))))))((((((((((...)..))))))))))))))).
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((.........)))...((((.......))))......(((((.......)))))))))))...).
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))......
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((([[[[[[[..)))).]]]]]]]..))(((.{{{))).(((((}}}....))))))))))).....
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.((((.((((((.........))))))...((((...........))))......)))))))))).....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.((...)).)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((((((((...((((.(((((..(...))))))))))..))))))...)..)))))))))).)...
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))).....
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))).....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))......((((.......)))).)))))).....

---