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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00520



RNA: SPR_00520
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((.((..((((.....)))).(((((.......)))))....(..((.......))..))).))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.........((((((((((((.......)))))......)))))))...))).....))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.......(((((.......)))))....))))))).....))).....))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((...((.......))..(((((.......)))))................))..............
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((((.....)))).(((((.......))))).......((.......))...)).))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((((.....)))).(((((.......))))).......((.......))...)).))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((...(((.....)))(.(((((.......))))).......)........))).....))).....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((..((((.....)))).(((((.......)))))......[[[[......))))........]]]]
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((.((((.....)))).[[[[)))......]]]]......((((...(((.......)))..))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((.......(((.....)))..(((((.......))))).........................)).....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((.((..)))))))(((((...))))))))))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((((.....)))).(((((.......))))).....................)).))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((.........((((((((((((.......)))))......)))))))...))))............
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.....)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((..((((.....)))).[[[[[.))....]]]]]......((((..................))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....((((.....)))).(((((.......)))))..(((........)))........))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(((.((((.....)))).(((((.......)))))(((......)))..))).......))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((..(((((((.......(((((.......)))))....))))))).....))))............
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(..(..)..(((((((.((((((((.(((..))))))..))))))))).)))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((..((.....((((((((((((.......)))))......)))))))....))..)).))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((..((((.....)))).(((((.......)))))..((((......)))).....))..)))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..((..((((.....)))).(((((.......)))))..((((......)))).....))..)))....