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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00533



RNA: SPR_00533
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.......)))..(((((.......))))).((((....))))....)))))..)))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).((((((....))))..))...)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.......)))).(((((.......))))).((((....)))).......).)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).((((....)))).........)))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.......)))).(((((.......))))).((((....)))).......).)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.[[[[..)))).(((((.]]]]..))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((((..((((.......[[[[[.))))..]]]]].(((.[[[[[)))....]]]]]...))))))..
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.(((((......))))).)))....(((....))).(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.((((........)))).)))...........((((....)))).........)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.{{....))).}}[[[[)).....]]]]..(((..<<<<)))....>>>>.)))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.(((((......))))).)))....(((....))).(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.((....))))))))((((...........))))(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.(((((......))))).))).)..(((....))).(((((.......))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((((.......)))..(((((.......)))))...(((......)))..))))))).........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).((((....)))).........)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((.......)))).(((((.......))))).((((....)))).......).)))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.((((........)))).)))...........((((....)))).........)))))))....
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