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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00550



RNA: SPR_00550
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((...........))))((((((.......)))))).............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((...((((((((((.........((((.........)))).)))))))))))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((....))).....(((((((((((..(((((..........))).))....)))))))))))...)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((.......)))(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((.......))))))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((.......))))))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((.......)))(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........(((((.....[[[[[[[[[[[......)))))(((....)))......]]]]]]]]]]]...)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((....))).....(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....((.........))(((((((((((...........(((....)))....[[)))))))))))]].)))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(...........)(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((((((...........((((..))))......)))))))))))...)))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((...........)))).(((((.(...).)))))..............(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((.......))))))((((((.......))))))(((....)))...(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((.......)))((((((((((............(((....)))...[[[.))))))))))]]])))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......................(((((.......)))))..............(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((((((...........................)))))))))))...)))))))....
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((....))).....(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((....))).....(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((....)).((((((.(.(((((.(....))))))..(((((........)))))))))...)))).))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((....))).....(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((....))).....(((((((((((...........(((....)))......)))))))))))...)))))))....
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((.......))))))..((((.......)))).(((.........))).(((.......)))..)))))))....