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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00552



RNA: SPR_00552
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(((.........)))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (....((((((((........((((......))))...........(((((.......)))))..)))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((......((((......))))............((((.......))))))).))))))).
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((((..(((..(((...(((((....))))).....)))...)))..)))))).)))))).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((((((................(((....)))......(((.......))))))).))))))).
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........)))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.........))).......................((((.......)))).)))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((((((..............((((((()))))))....(((.......))))))).))))))).
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((........((((......))))...........(((((.......)))))..)))))))).
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((..(((((..((((......)))))))))......(((((.......)))))...))))))).
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((((((((.((.((...(((((....)))))....)))))))))....)))).))))))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((((((.....((((......)))).............(((.......))))))).))))))).
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((................................((((.......))))))).))))))).
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))...))))))))))).)))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((.......((........)).............((((.......))))))).))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((.............((((((...)))))).....(((((.......)))))..)))))))).
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((((((..((((......)))))))))......(((((.......))))))).))))))).
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((......((((......))))............((((.......)))))))).)))))).
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((...(((.........(((((....)))))...[[[[.)))...]]]]))).))))))).
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((.(((((((......)))....(((((((........)))))))....))))...))))))).
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((........((((......))))...........(((((.......)))))..)))))))).
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((........((((......))))...........(((((.......)))))..)))))))).
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((........((((......))))...........(((((.......)))))..)))))))).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((......((((......))))............((((.......)))))))).)))))).
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((.(((((((((.((.((((.((((((..)))))).)).))))))))...)))))...)))))).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((......(((........))).............(((.......))).))).))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((........((((......))))...........(((((.......)))))..)))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.........)))))....(((((....)))))..(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((.........)))))....(((((....)))))..(((((.......))))).))))))....