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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00629
RNA: SPR_00629
Rfam family:
-
| GAGAUAUUAGUAUAAAUUUUUUGUAUAUUUCUUUUUCGAAGAAAAGGUUUAUUAUCUUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ((((((...((((.........)))).(((((.......)))))........)))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.(((((((((...))))))..(((((((...)))))))....))).)))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...)))))))...(((((((....))))))).....)))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((.........................(((.......)))............))...... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .............................................................. |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..........((((((.................)))))).......)))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((......((((..............(((((((...))))))))))).)))))..... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....[[[[[[[[[[[..)))))))..........]]]]]]]]]]].......... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...))))))).(((((((...)))))))........)))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....(((((((((((.....((((......))))))))))))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((([[[[[....[[[[[[[.))))))).....]]]]]]]..(((.]]]]]....))). |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..............................................)))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((...))))))))(((((((((...)))))))))))))))))).... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...))))))).(((((((...)))))))........)))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....(((((((((((...................))))))))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((((.....)))))).((((((.....)))))).(((..........))). |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((((.....))))))....(((((((...))))))).....)))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...))))))).(((((((...))))))).[[[....))))))]]]. |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........................((((((.....)))))).(((..........))). |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...)))))))....(((((((...))))))).....)))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((((.....))))))....(((((((...))))))).....)))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...)))))))....(((((((...))))))).....)))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((.....)))))).(((((((...))))))).....)).)))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((.(((((..))))).......(((((......)))))..)))))))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...)))))))...(((.......)))..........)))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((((...)))))))....(((((((...))))))).....)))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((((.....))))))...((((.....)))).(((((.....))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........((((((.....))))))...((((.....)))).(((((.....))))).... |