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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00633
RNA: SPR_00633
Rfam family:
tRNA
| UCCGAUGUGGUAUAGUGGAUAGAACAAGCGGCUCUCACCCGCUAGACCCGGGUUCGAUCCCCGGCAUCGGAA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((.(........).)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))). | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.(.....).)))...)))))).))).(((......)))..))))))).) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))). |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).))).(((.......))).)))))))). |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))). |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))). |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....................((((.......)))).....(((((.......)))))))))))). |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))). |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......((((........[[[[[...))))]]]]]....(((((.......)))))))))))). |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))). |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((......((((.((((...(((.(((........))).))).)))).)))))).)))))))). |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.(.....).)))...)))))).))).(((......)))..)))))))). |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((.......((....[[[[.))....]]]])).)))((((.......)))))))))))). |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((((((...)))))).))))))))))))(((((...)..)))))))))))). |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))). |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))). |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))). |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))). |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((...............))(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))). |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((......((((.((((...(((.(((........))).))).)))).))))))).))))))). |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))). |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))). |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))). |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.(.....).)))...)))))).))).(((......)))..)))))))). |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).))).(((......)))..)))))))). |
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| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((......((..((((((((.((.(((........)))))))))))))..)))).)))))))). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).)))((((.......)))))))))))). |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((.((((((..(((.........)))...)))))).))).(((......)))..)))))))). |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...................(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......(((((.......[[[[[.)).)))]]]]]....(((((.......)))))))))))). |