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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00721



RNA: SPR_00721
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.((((...((.((.(((((((...)))))))..)).))))))..))))....))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((...((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))).......
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).))))))....
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .............................................................................
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...................(((((((...))))))).....................))))))))....
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CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...[[[[.))))))..]]]]..........(((((....))))).((((((........))))))......
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..[[[[)))))))..]]]](((.......(((((....))))).[[[[[[.)))....]]]]]]......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........))))(((.(((((.(((((....))))).)))))..)))....))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........))))(((.(((((.(((((....))))).)))))..)))....))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........)))).(((..[[..[[[[[))).]]]]]((]].........))))))))))....
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MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))))....
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .............................................................................
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((((...))))))).....(.(((.......))).))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))..((((.......))))......(((((.......))))))))))...)).
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..[[[[)))))))..]]]].(((((((...))))))).(((..(((((((........))))))).))).
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((....)).)))).(((((((...)))))))......(((.........)))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..((((.........)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))).....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))))))))))....
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........))))(((.(((((.(((((....))))).)))))..)))....))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........))))(((.(((((.(((((....))))).)))))..)))....))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......))))))).....(.(((((.......)))))).((.((((((...)..))))).))(((..)))
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (..(.......................................................(.)..........)..).
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........))))(((..((((.(((((....))))).))))...)))....))))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.........)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........))))(((.((..(.(((((....))))).)..))..)))....))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........))))..........(((((....))))).(((.......))).))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((..[[[[...)))).]]]].....(((((....))))).(((.......))).))))))))....