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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00722



RNA: SPR_00722
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....((.((.......)).)))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).((((((....)))))).....)))))))....
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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......))))).((((((....)))))).....)))))))....
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