 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00750
RNA: SPR_00750
Rfam family:
tRNA
| AGAAAUAUGUCUGAUAAAAGAGUUACUUUGAUAGAGUAAAUAAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).(((((.......))))).....(((.(.......).)))))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((............((((((((((...))))))..........)))).........))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((............(((((.(((...((.......))..)))))))).........))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......................((((.......)))).(((...................)))........ |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((.(.......).)))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......((.(.......).)).))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((....................(((((.....)))))(((((..((.(.......).)))))))))..... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............((((((.....))))))......................))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((...........)))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((......))).(((((((...))))))).....(((...........))).)))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((................((((.......)))).......((...........)).))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..))))((((((((((((((((((...))))))))))((((((((((..)))))))))))))))))) |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).(((((((...)))))))......((...........)).))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............(((((((...))))))).....(((...........)))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((....)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((....)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....)))))).....(((...........)))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).(((((((...))))))).....(((...........)))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................(((...........)))........... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...............(((((((...)))))))......................))))))).... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((........))..(((((((.......)))))....................)).)))))).... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((......))).((((((.....))))))......................))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..................(((.((((((.....)))))).(((..((.........))..)))..))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..................(((.((((((.....)))))).(((..((.........))..)))..))).... |