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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00810



RNA: SPR_00810
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..(.(...........).).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((..(((((((.......(((((((...)))))))((((....)))).)))))))...)))....)))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.((((((......(((((((...))))))).(((....))).))))))))))...)))..)))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(..(((((((.......(((((((...)))))))((((....)))).)))))))...)......)))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((((...)))))))((((....)))).(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......)))))((((....)))).(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((..((((((((......(((((((...)))))))((((....))))))))))))...).))...)))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........((((........((((((.....))))))((((....)))).[[[[[.))))..]]]]])))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...((((((((......(((((((...)))))))((((....)))))))))))).....)))..)))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((....)).))......(((((((...)))))))((((....)))).(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.((((((......((((((.....)))))).(((....))).))))))))))...)))..)))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((....(((((((......((((((.....))))))((((....)))))))))))......))...)))))))....
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((((((((((((((((((((...))))))))((((..)))))))))))).)))))))))))))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((...(((((.......(((((((...)))))))((((....)))).)))))..))...))...)))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((..))).........(((((((...)))))))((((....)))).(((((.......))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).))))).............(((((.......))))))))))))....
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((.....)))((....)).((((((.....))))))((((....)))).(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..........))))........................(((...........(((((.......)))))...))).....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((((...))))))).............(((((.......))))))))))))....
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.((((((......(((((((...))))))).(((....))).))))))))))...)))..)))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((((((((......((((((.....))))))((((....))))))))))))))...)))..)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(...........)))).(((((.......)))))(((((..)))))..(((((...)..))))..))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((((((((......(((((((...)))))))((((....))))))))))))))...)))..)))))))....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((................)))(((.....)))...((((....)))).(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.....[[[[.))))).......((((((.....)))))).(((....)))..(((((]]]]...)))))...........