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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00912



RNA: SPR_00912
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((...))).)))).(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((...)))).)))).(((((...((((((((.....))))))))..))))).))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...))).)))))(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...................((((((.......)))))).....((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..........)))).(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((((((.)))).)))))(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....((([[[[.)))...((((((((.]]]]))))))))...(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))).))))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...))).)))))(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))).))))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...)))).)))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...))).)))))(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...)))).))))(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..........)))).(((((.(...).))))).....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((..........)))))((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...)))).)))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...))).)))))((((((...((((((((.....))))))))..).))))))))))))....
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((..........)))))((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((....((((...))))......(((((...((((((((.....))))))))..))))).))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))).))))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...))).)))))(((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...)))).)))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..((((........)))).((((((..(...))))))).....((((.((..))))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((.(((...)))..))).(((((....((((((((.....))))))))....))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((((...))).))))((((((....((((((((.....))))))))....))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((.....)).))).(((((((.....))))))).....((((.......)))).)))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((((.....)).))))).((((....((((((((.....))))))))....)))).)))))))....