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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_00932



RNA: SPR_00932
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........)))))))))))).((((((((((....((((.......))))))))))..))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.........)))))))))))).(((((((((....(((((.......))))))))))..))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((....)).))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.................(((((((.......)))))))...((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((....)).))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......)))......((((((.......))))))....((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((..[[[[..)))....]]]].(((((((......[[[..)))))))(((((....))))).]]]......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((......)).(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((......)))...((((.((((......))))))))..(((((.......))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (([[((((..................))))[[)).((((]](((....(((((.......))))))))]]..))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..)))))))))))))))).(((((((((....((((((...)..))))))))))..))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(......).)......)))))).......(((((....(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))))....
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.<<<<....)))).(((((((.[[[[..>>>>)))))))(({{{.)).}}}))))))))]]]]
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.........)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))))....
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((......)))..(((((.((((......)))))))).)(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((......))..((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((({{{...)))}}.}............[[[.........((((((....).))))).))))))]]].
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....................(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))))....
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((((....)).)))))))))))).(((((((((....(((((.......))))))))))..))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((...((......))..((((((.......)))))).)))((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((....))).))))))))))).((((((((..(..((((((...)..))))))))))..))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((..................)))))))...((.(((((....(((((.......))))))))))...)).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((......)))...((((.((((......))))))))..(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((....)).))).((((((.......))))))....((((.......))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((....)).))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....