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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SPR_01106



RNA: SPR_01106
Rfam family: tRNA

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((.((..((((.(((((((((.......)))))).)))))))...))))).))))))).
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))).
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..(((((.....)))))......(((((.......)))))))))))).
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((.......))))((((.............))))..))))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..(((((.....)))))......(((((.......)))))))))))).
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..[[[..))))....((((((....]]]))))))(((((.......)))))))))))).
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))(((.[[[[[[.)))...]]]]]](((((.......)))))))))))).
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((...))))...((((((............)))))).))))))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((...))))...(((((((.(......).))))))).))))))).
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))...(([[[[[....)).]]]]].(((((.......)))))))))))).
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MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))..((((((...))))))......(((((.......)))))))))))).
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((...))))...((((((............)))))).))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((...))))...(((((((..........))))))).))))))).
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......))))).)))))).
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PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))).
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.......))))..))((((((.......))))))(((((.......)))))))))))).
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((...))))...(((((((..........))))))).))))))).
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......))))................(((((............)))))..))))))).
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UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).((((...))))...((((((............)))))).))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))).)))))).
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