RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00002

RNA: SRP_00002
Rfam family: Metazoa_SRP

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((((..((((........))))...)))))...)))).((((((((..(((((...(((((((.....(((.((((((((..(((((((.....(((((((((((((((..(((.((((((((..((((((((..(((....)))..))))))))..)))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))))).))))....))))))))..))))))))))))))))))))))))).....)))))..)))))))).....
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((((.((((........)))).)).))))...)))).((((((((..(((((...(((((((.....(((.((((((((..(((((((.....((((((((((.(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))..)))))))...))))))))..))))))))))))))))))))))))).....)))))..)))))))).....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((((.((((........)))).)).))))...))))(((((((((..(((((...(((((((.....(((.(((((((..((((((((.....((((((((((.(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))))......(((((......(((....(((....)))....)))....)))))...))).)))..)))))))...))))))))..))))))))))))))))))))))))).....)))))..)))))))))....
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((.((((........)))).)).)))).).))))(((((((((..(((((((.(((((((.....(((.((((((((..(((((((.((..((((((((((.(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))..)))))))...)))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))..)))))))))....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((........))))))....(((((((......(((((((((..(((((.............))))).....(((((((..((((((((.....((((((((((((.....((((...((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).)))))).............((((...((((......................))))..))))...)))).)))))....)))))))..))))))))))))))).)))))))))....)))))))..............
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................(((........))).....((((......(((((....((((((.................................((((((((.(((((...((((((((((..(((((..((((((....))))))..)))))..)))......(.(((((......(((....(((....)))....)))....)))))))))))))....)))))))...))))))..(......)............))))))......)))))......)))).....
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.((((((.((((........)))).)).)))).((((((((........)))))))).(((((((.....(((.((((((((..(((((((.....((((((((((.(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))..)))))))...))))))))..)))))))))))))))))))))))))....)))).((...)).........
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((.((((........)))).)).)))).).))))(((((((((..(((((...(((..((.....(((.(..((((...(((((((.....((((((((((.(((((.(((.(((((((((.((((((((.((((....)))).)))))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))..)))))))...))))))))..))))))).))))..))))))..))).....)))))..)))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((((..(((........)))..)).))))...)))).((((((((..(((((...(((..((.....(((.(..(((((..(((((((.....((((((((((.(((((.(((.((((((((..((..((((..(((....)))..))))..))..)))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))).)))..)))))))...))))))))..))))))))))))..))))))..))).....)))))..)))))))).....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((........)))))....(((((....))))).....(((...(((((.............))))).....((((.(((...((((.((....)))))).)))))))...)))..((((....)))).((((..(((....)))..)))).((((((((((..................((((.(((....................)))((((...........))))..))))...((((((.....)))))).))))))))))....(((((.....)))))........
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((...)).)))))[[[.(((((....))))).))).(((]]]..))).......(((.....(((.....<<<<.)))...((((.((....))))))....>>>>...)))..((((....)))).((((..(((....)))..)))).(((...aaaaa.........))).(((.....((((...........AAAAA.....)))).)))...(((((...((((..{{{))))((((.....))))..}}}.....((((.......)))).))))).........

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