RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00008

RNA: SRP_00008
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((..((..(((...(((....))).....)))..))..))))))))))).))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((..((..(((..((((....))..))..)))..))..))))))))))).))))))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((.....(........(((.....(((....))).....)))......).........))))))))).
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..................(((....)))..................))))))).))))))))
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).))))))).
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))..))))))..
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.(((....))).......(((....))).....(((....)))...))))))).))))))))
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((..((..(((..((((.....)).))..)))..))..))))))))))).))))))))
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MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)).)))...))))...))))))))
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.........................(((....)))..........................))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((..((..(((..((((.....)).))..)))..))..))))))))))).))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((..(((((............)))))............))))))))))).))))))))
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................(((.....(((....))).....)))..........................
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).))))))..
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PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................(((.....(((....))).....)))..........................
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................(((.....(((....))).....)))..........................
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.(((.(.....)))).(((((....))).....(((....))).))))))))).))))))))
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((......(((..((((.....)).))..)))......))))))))))).))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((.........((((.(((..........))).....))))...))))))).(((.......))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((...(((((............))))).........))))...))))))).))))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.........................(((....)))..........................))))))))
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))....................
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..........((((.....(((.....(((....))).....)))...)))).............))))).
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..(((...(((((.((......).))))))...((((..)))))))))))))).))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................(........(.......(........((....)).........)....).........)
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((..(...(.((((.....(((.(...(((....))).)...)))...)))))....)...))))......
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((..((..(((...(((....))).....)))..))..))))))))))).))))))))
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((.....(((.....(((....))).....)))...))))...))))))).))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..((((..((..(((...(((....))).....)))..))..))))))))))).))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.((((............((((............))))..))))...))))))).))))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.[[[[[[.))))))...(((((............)))))..........]]]]]].(((........))).

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