RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00009

RNA: SRP_00009
Rfam family: Plant_SRP

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........)))))))...(((....)))......((((((((((((.((((((((((....))))))))))))..(((((((((.(((....)))))))).((((..(((((((((((((..(((((((((((((....)))))))))).)))))))........(((((((..(((((((((....))))))...)))...))).))))..)))))))))...)))).((((..((((((((...)))..))))).....((((....)))).))))..))))...))))))))))
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........)))))))...(((....)))......((((((((((...((((((((((....)))))))))).(.(((((((((..((((((((((...((.(((((.(((((((((....((((.((((((((((....)))))))))).((..(((((.(((((((...(.......)....)))))))...))))).))...))))....)))))))))..)))))))...(((......))).))))))))..))....))))))..))).).((......)).))))))))))
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........)))))))...(((....)))......((((((((((...((((((((((....))))))))))........(((((.(({{{{{{))))))).(((((.(((((((((....((((.((((((((((....)))))))))).....(((((......[[[.........((((((....)))))))))))......))))]]].)))))))))..))))).....(((......)))...}}}}}}.......((((....))))..............))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........)))))))......((((....)))).((((((((((.....((((((......(((((.....)))))..(((((......((((((((....(((((.(((((((((...((((..((((((((((....)))))))))).....(((((.(((((((................)))))))...)))))....))))......)))))))))..)))))......))))))))....)))))))))))....((((....))))..............))))))))))
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................(((....)))........................................((((((.....(((........(((((((.((.(((((.((((((((.((((((...((((((((((....))))))))))..))))))........(((((......(((....(((......)))....)))....)))))..))))))))..)))))))....)))))))...)))...)))))).........................................
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((....((((....))))..((((((((....))).......)))))....)))))))).((...(((((((.......((((((.((.((((((((...((.(((((.(((((((((..((((((((((((..(((....)))..))))).)))....))))....(((((((..(((((((((....))))))...)))...))..))))).)))))))))..)))))))...(((......))).)))))))).)).....))))))....))))))).....))...........
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((........))))))....(((....))))))...((((((((.((((....))))(((((...(((((((..(....(..(((.((.((((((((...((.(((((.(((((((((..((((((((((((..(((....)))..))))).)))....))))....((..((((.(((((((((....))))))...))).....))))..)))))))))))..)))))))...(((......))).)))))))).)).....)))..).)..))))))).....)))))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((........)))))(((.((((....)))))))..((((((((((..((((((..((((..(....((((((((((.((.((((..)))))((.((((..)))).))((((.(.......)))))...(((..)))((((.((.((((((((((.(..((......))...)...)))))))).)))))))))))))))..))))......(((((......))))))(..).((.(((((((.(((......)).).))).))))...)).))))..).)).)))..))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................................................................(.........).(.(..((......(((((....(.((.(..(......((.((.(((..((...((...((((......))))........(((.(......(((...(((..........))).))).....))))...))...))....)))......))...)).....)).))...)...........))))).................))..).)..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........)))))))...(((....)))......((((((((((..((.............................(..(((....((((((((...((.(((((.(((((((((.....(...(((((..(((....)))..)))))..).............(((((((..(((((((((....))))))...)))...))..))))).)))))))))..)))))))...(((......))).))))))))........)))..)...............))..))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........)))))))...(((....)))......((((((((((...((((((((((....))))))))))....(((((((..((.((((((((...((.(((((.(((((((((......((((((((..(((....)))..))))).)))............(((((((..(((((((((....))))))...)))...))..))))).)))))))))..)))))))...(((......))).)))))))).))....((((....))))....)))))))...))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........)))))))..((((.(((.((((.(((.....))).((((....))))...)))).((((((....)))..((((((...........)))))).)))..((((........))))..((((((((((....)))))))))).)))...(((......))))))).....((((((....))))))......(((.........))).(((....)))...(((((..(((((...........))))).....((((....)))).)))))..................
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((........))))))).((((.((((....))))......(((.....))))))).(((((..((((.....)))).((((((((...........))))).......(((([[[[[...))))..((((((((((....)))))))))).)))(((((...(((({{{{{......{{{{{)))).((((....)))).(((....}}}}}))).(((....)))((((..}}}}}......))))]]]]]))))).....((((....))))...........)))))........

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