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GGCGGGUCUCCCCGCAUUGCAGCGCGGUGAACCUGGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCCACAGCCGUUCCCUGCAAGUGCCGGGGGUCAGGCUCGCCACCCCGAACA |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................................................................................... |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................((((((...................(((....)))..................))))))............................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
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Cylofold
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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|
DotKnot
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Fold
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HotKnots
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IPknot
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
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MXScarna(20)
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Mastr(seed)
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Mastr(20)
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MaxExpect
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|
McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
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Murlet(20)
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PETfold_2.0(seed)
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PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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|
PETfold_pre2.0(20)
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PPfold(seed)
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.......................................................................................................... |
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PPfold(20)
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PknotsRG
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
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((((((((((((((..((((((.(((((....(((((....)))))...............)))))...))))))....))))))...)))))))).......... |
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RNASampler(20)
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[ FASTA input ] |
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RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.........................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).......................................... |
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RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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................(((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))))............................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...))))))))).......... |
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RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((....................(.(((.....((((....(.(.....))....))))..)))......................)..))).............. |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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Sfold
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[ FASTA input ] |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
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...(((....))).(((((.....)))))...(((((....)))))..((((((((.............))))...)))).(((((..((....)))))))..... |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
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