RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00038

RNA: SRP_00038
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))))..)))))))))....
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((((..(.....)..).)))))))).....(((.(((........))).)))...(((..(((((((((....))))))))).)))...)))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((((((((.....)))).))))))))((((....(((....)))....))))....(((....(((((((....)))))))...)))......
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((....((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).....)))))..)))))))))))....
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................((((..................)))).........(((((((((....)))))))))..........
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((..(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))))).)))))))....))))).......
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(..(((((((((((....))))....))))))).....(((.(((........))).)))...(((..(((((((((....))))))))).)))).....
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.....)))).))).....((((....(((....)))....))))............(.((((....)))).))))))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))))..)))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((..(((((((((((....))))....)))))))..((.(((.(((........))).))).))(((..(((((((((....))))))))).)))))....
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.........))))))((((((.....(((....)))....{{{(..{{{{..))))))..)}}}..}}}}.))))))))))....
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................((((....(((....)))....)))).........................................
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((((((((.....)))).))))))))((((....(((....)))....))))....(((..(((((((((....))))))))).)))......
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((((((((..((...))))))).)))).((.(((.(((........))).))).)).....(((((((((....)))))))))))))))....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))..)))))))))))....
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MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.((((((.((((((((...))))).)))(((((..))))))))))))))))))...((((((((((..))))))))))))))))....
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NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((aa((((((.<<<<<.))..bbbbbbbb..)))).(({{BB>>>>>(((...[[[((BBBBBB))))))).]]]))))))))))))AA}}
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PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................((((....(((....)))....)))).........................................
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((.(.(.(((....)))..).)))).........................................
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))..)))))))))))....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((.(((((.........)))))..)))....(((.(((........))).)))........(((((((((....)))))))))))))))....
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RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................((((....(((....)))....)))).........................................
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((..(.....)..).))))))))((((....(((....)))....)))).........(((((((((....)))))))))..))))....
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RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.....................(....(...(.((((....(((....)))....)))).................)............).....).)).
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((..((.(((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....))).))...))...))))))))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((............................((((....(((....)))....)))).........(((((((((....)))))))))))))))....
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.....)))).)))))...((((....(((....)))....))))...........(((((((....))))))).)))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))..)))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((....))))....(((..(((((.....)))))..(((.((...........)))))))).(((....))).)))))))))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((.....[[[[)))))..(((((.....)))))......]]]]......(((..(((.....)))...))).)))))))))))....

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