RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00045

RNA: SRP_00045
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((.(....(.......(.(..((((((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))...))))..).).......)....).))))....
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((....(((......))).((((((((.(((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.................((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................((((((((.((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))))).))))))...))))))))..................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......)))).........(..((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))..).((((.......))))...............
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((...........))..((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((....(((......))).((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.................((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((......((.....))..((((((((.((((((((((((((((((((...((..(((....)))..))...)))))))).........)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..................((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...)))))))).......)))))))))...((((....))))...
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MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.................((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.................((((((((.((((((((((((((((((((.......((((..)))).......)))))))).........)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((......((.....))..((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((....(.((.....))).((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.................((((((((.((((((((((((.((((((.....((((..................))))..))))))...))))))).)))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((......((.....))..((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((......((.....))..((((((((.((((((((((((((((((((...((..(((....)))..))...)))))))).........)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((......((.....))..((((((((.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))).))))))...))))))))......))))))))))...((((....))))...
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((...........)))))...)))))).((((....))))...((((......)))).....((((((....((.....)).)))))).....(((.((....))))).((((((....)))))).....((((....))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...[[[[)))).........]]]]...(((((..((((....)))).((((((......)))..((((...........))))..)))...........(((.((....))))).)))))...((((....)))).((((....))))...

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