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GGGAGAUUGGCGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGGUCCGGAUCGGGUCGCUCGUCAGUCUCCUACCUGUUUU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(((((((((..(((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))))...))))))))).........
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(.((((((((((.....)))).)))))).)((((....(((....)))....))))....((.(...((..(((.....)))))...)))........... |
|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((..(((.....(((((.....)))))..(((((((((((.......))).......))))))))..)))..)))))))))))))......... |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................................(((....)))..................................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((..((((((...(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....))))))...))..)))))..))............ |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((....(((.....)))............(((((((((((.......))).......)))))))).......)))))))))))))......... |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).))))))))))))......... |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((...)))))).....((((.(((((((((((.......))).......)))))))).))))).)))))))))))))......... |
|
Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....))))..(((.....)))..((((((((........{{{(.....{{{)))))))))}}}....)))))))))))).}}}..... |
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DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....))))............................................. |
|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((...((((...))))...)))((((..[[[[[[[[........))))........]]]]]]]].........)))))))))))......... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....))))...((..(((((.....)))))..)).(((.((((...((.....))....)))).)))))))))))))))......... |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).))))))))))))......... |
|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).. |
|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((.((((.(((((((.((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...).))))..))).).))).)))))......))... |
|
MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.((((...))))))).(((((.....)))))......((.((((...((.....))....)))).)).))))))))))))......... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................(((((..........(((((...............................)))))........)))))................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....))))............................................. |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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........(((((...(((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....))))))...))..))))................. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....))))............................................. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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........(((((...(((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....))))))...))..))))................. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....))))............................................. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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..................................(((.(.(.(((....)))..).))))............................................. |
|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).))))))))))))......... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.((((...))))))).(((((.....))))).....(((.((((................)))).)))))))))))))))......... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((....((((...)))).......((((.((((((((....................)))))))).))))..)))))))))))))......... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....))))............................................. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))........................................ |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....))))............................................. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).))))))))))))......... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(((....((((......((((....(((....)))....))))...)))).......)))..)))).))))))))))))......... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((...))))))).))((((....(((....)))....))))....((((.((......)).).))))))))))))))......... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((.((((..(...((((((((((((..))))))))))))..)))))....))))).)))))).))))))))))))......... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((....................(......(....(.(.(...(((.......(....(.....).....)....).))....).))...)....)..))..... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.............(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))...............))))......... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((..((.(((.....)))))............(((....)))................................))))))))))))......... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.....)))).))))....((((....(((....)))....))))..(((((..((......))...)))))..)))))))......... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).))))))))))))......... |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((...(((((((((.....)))).))))).(((((.....)))))...............(((((..((......))...)))))...))))........... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((...(((((((((.....)))).))))).(((((.....)))))...[[[[[[[.....(((((.(((.....)))...)))))...))))....]]]]]]] |