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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00051



RNA: SRP_00051
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((..(((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))))...))))))))).........
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.(..((.((..(((((((.(((((....((((......(((....)))....((((....).)))))))..))))).)))))))..)).))....).))))
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(.((((((((((.....)))).)))))).)((((....(((....)))....))))....((.(...((..(((.....)))))...)))...........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((..(((.....(((((.....)))))..(((((((((((.......))).......))))))))..)))..))))))))))))).........
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CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((..((((((...(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....))))))...))..)))))..))............
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................................(((((..((((....))))..))))).............................................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((....(((.....)))............(((((((((((.......))).......)))))))).......))))))))))))).........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.....)))).))))....((((....(((....)))....))))...........((.............)))))))))).........
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).)))))))))))).........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((...)))))).....((((.(((((((((((.......))).......)))))))).))))).))))))))))))).........
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.....))))..(((.....)))..((((((((........{{{(.....{{{)))))))))}}}....)))))))))))).}}}.....
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.....))))...((..(((((.....)))))..)).(((.((((...((.....))....)))).))))))))))))))).........
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).)))))))))))).........
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.....)))).........((((....((([[..)))....)))).........]].............)))))))))))).........
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MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((.((((.(((((((.((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...).))))..))).).))).)))))......))...
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((.((((...))))))).(((((.....)))))......((.((((...((.....))....)))).)).)))))))))))).........
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((...))))))).((((..[[[[[)))).(((.......))).....((((((...))))))..)))))))))))))]]]]]....
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PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................................((((....(((....)))....)))).............................................
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((...))))))).))((((....(((....)))....))))....((((.((......)).).)))))))))))))).........
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((.((((..(...((((((((((((..))))))))))))..)))))....))))).)))))).)))))))))))).........
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((....................(......(....(.(.(...(((.......(....(.....).....)....).))....).))...)....)..)).....
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.............(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))...............)))).........
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((..((.(((.....)))))............(((....)))................................)))))))))))).........
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((.....)))).))))....((((....(((....)))....))))..(((((..((......))...)))))..))))))).........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((.((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).)))..)))).)))))))))))).........
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...(((((((((.....)))).))))).(((((.....)))))...............(((((..((......))...)))))...))))...........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...(((((((((.....)))).))))).(((((.....)))))...[[[[[[[.....(((((.(((.....)))...)))))...))))....]]]]]]]