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GGGAGGUUGGUGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGCCACGGCACGGGUCAUCGUGCCAGCCUCCCACCCUUUCU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((.(((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....))).))..)))))))..))))))))).........
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).))))))))((((..((..((..(((.......)))..))..))..(((((((....)))))))........)))).)))) |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......((((((..............))))))..((((....(((....)))....)))).............................................. |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((.(((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....))).))..)))))..)))))))))))......... |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................................(((....)))...................................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((..(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))))).)))))))....)))))............ |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((.....))))..)))..((((.......)))).(((.......)))..........(((((((....)))))))))))))))......... |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((.(((.((((......((((....(((....)))....))))...))))....))).))..)))))))..)))))))))......... |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).))))..(((((.....))))).(((.......)))..........(((((((....)))))))))))))))......... |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....))))).(((..{{{)))....(((....)))....((((..[[[[....}}}...))))..]]]])))))))))))......... |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((.....)))).))))))))((((....(((....)))....))))......(((..[[[[[[)))...]]]]]]................. |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).))))).(((((.....))))).(((.......)))..........(((((((....))))))).)))))))......... |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).)))))...((((....(((....)))....))))...........(((((((....))))))).)))))))......... |
|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).))))))))((((....(((....)))....))))...........(((((((....)))))))....))))......... |
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MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.((((((((((...))))))))))((((((((((((..))))).)))))))...((((((.((((((((..)))))))))))))))))))))))). |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.(((((((.((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...).))))..)))..))))).)))))))......... |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................................................................................... |
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Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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...........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....)))))).))))))...................... |
|
PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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...........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....)))))).))))))...................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
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..................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
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PPfold(20)
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[ FASTA input ] |
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..................................(((.(.(.(((....)))..).)))).............................................. |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).)))))...((((....(((....)))....))))...........(((((((....))))))).)))))))......... |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.....((((...))))....((((((...)))))).........((((................)))).....))))))))))))......... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))......................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).)))))...((((....(((....)))....))))...........(((((((....))))))).)))))))......... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.((((((((((((.....)))).)))))))).(((..((..((..(((.......)))..))..))..(((((((....))))))).))).....)))..... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((((.((((...))))))....((((....(((....)))....))))......)))))(((((((....)))))))))))))))......... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(...)))))((((..(...((((((((((((..))))))))))))..)))))((..))((((......))))))))))))))......... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..........................(....(.(......((........(....(.....).....)......))....).)....)........))).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.....)))).))))....((((....(((....)))....))))...........(((((((....))))))).)))))))......... |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((.....)))).))))....((((....(((....)))....))))...........(((((((....))))))).)))))))......... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....)))).)))))...((((....(((....)))....))))...........(((((((....))))))).)))))))......... |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((((.....)))).))))..(((((.....)))))...................)))..(((((((....)))))))................. |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((.....)))).))))).(((((.....)))))........................(((((((....)))))))..........)))))). |
