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Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((..((((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).))).)))).....))))))))))))))).... |
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((.(.(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)).))))))).).....))))))))))))))).... |
CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((((....(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)).)))))))........)))))))))))))).... |
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((.(.(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)).))))))).).....))))))))))))))).... |
Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((..............(((((....(((....)))....))))).............))))))).......))))))))))))))).... |
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......))))))).......))))))))))))))).... |
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.........((((((.(((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).))).)))....))))))........)).... |
Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................. |
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((.....(((((....((((((((..)))..........))))).))))).......))))))).......))))))))))))))).... |
PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).))))))......................... |
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)))).))))).......))))))))))))))).... |
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((.(..(((((....(((....)))....)))))))))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).......................................... |
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
RNAshapes
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).....)))))...))))))).......))))))))))))))).... |
RNAsubopt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)))).))))).......))))))))))))))).... |
RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((....(((((((..((((..))))..))))))).)))))...)))).))))))).).)..))))))))))))))).... |
RSpredict(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.................................((.(..((((..((.(..((.......(.(...............).)...))..).).)..))))...).))..).... |
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((.(((.......))).(((.......))).((((..................))))...........)))).((((...........)))).))))))).... |
Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((..((((....[[[[))))..(((...........]]]]...........))).(((....)))....))))).))))))).... |