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GGAGAUUUCUGUUAGUCCUAAACACUGUUAAAUUGAAUAAUUGGUCAGAUCUGGAAAGAAGCAGCCAAAUCAAUCGAUACAGGUGUUUUGAUAUAGCUAACAGAAUCUCCUAUA |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((..((((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).))).)))).....))))))))))))))).... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((..............(((((....(((....)))....))))).............))))))).......))))))))))))))).... |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......))))))).......))))))))))))))).... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.........((((((.(((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).))).)))....))))))........)).... |
|
Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................. |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((.....(((((....((((((((..)))..........))))).))))).......))))))).......))))))))))))))).... |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).))))))......................... |
|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)))).))))).......))))))))))))))).... |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((.(..(((((....(((....)))....)))))))))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..((((.....(((((((.....(((((....(((((..................))))).....)))))...))))))).....)))).....)))))))).... |
|
RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).......................................... |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...(((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).....)))))...))))))).......))))))))))))))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)))).))))).......))))))))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.((((((((((((((((((((.((.(((((....(((((((..((((..))))..))))))).)))))...)))).))))))).).)..))))))))))))))).... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.................................((.(..((((..((.(..((.......(.(...............).)...))..).).)..))))...).))..).... |
|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
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UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......))))))))))))))).... |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((.(((.......))).(((.......))).((((..................))))...........)))).((((...........)))).))))))).... |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((.......)))).(((((..((((....[[[[))))..(((...........]]]]...........))).(((....)))....))))).))))))).... |