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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00056



RNA: SRP_00056
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((.((((((((..(((((.((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)))))...)))).....)))))))))))))))....
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((..((((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).))).)))).....)))))))))))))))....
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((....(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)))))))........))))............
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((((((.(.(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)).))))))).).....)))))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((...((((((((....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).....)).)))))).......))))))))...........
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((((....(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)).)))))))........))))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((((((.(.(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)).))))))).).....)))))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((((((...(((((((..............(((((....(((....)))....))))).............))))))).......)))))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...(((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......))))))).......)))))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......)))))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......)))))))))))))))....
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................................................................................................................
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((((((...(((((((.....(((((....((((((((..)))..........))))).))))).......))))))).......)))))))))))))))....
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PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)))))).........................
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....)))).))))).......)))))))))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((((((...(((((((((...(((((.(..(((((....(((....)))....)))))))))))....))).)))))).......)))))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..((((.....(((((((.....(((((....(((((..................))))).....)))))...))))))).....)))).....))))))))....
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......)))))))))))))))....
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RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.................................((.(..((((..((.(..((.......(.(...............).)...))..).).)..))))...).))..)....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......)))))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((((((...(((((((((...(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))....))).)))))).......)))))))))))))))....
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((.......)))).(((((..((((....[[[[))))..(((...........]]]]...........))).(((....)))....))))).)))))))....